آیت الله محمد صدوقی، روحانی شیعه از روحانیان فعال در انقلاب اسلامی و نماینده امام خمینی در استان یزد و امام جمعه این شهر بعد از انقلاب بود. ایشان در مجلس خبرگان قانون اساسی نماینده مردم یزد در این مجلس بود و در یازدهم تیرماه سال ۶۱ پس از اقامه نماز جمعه به دست منافقان به شهادت رسید.
امام خمینی در یازدهم تیرماه سال ۶۱ به مناسبت شهادت آیت الله شیخ محمد صدوقی پیامی خطاب به ملت ایران صادر کردند.
امام خمینی در سی ام فروردین سال ۵۰ یعنی زمانی که در تبعید بودند، در نامه ای خطاب به مرحوم حاج احمد آقا خمینی اجازه فروش کتابخانه شان را صادر کردند.
شیرین ترین لحظاتش وقتی بود که می توانست برای همشهریانش کاری بکند. پروژه ای را به پایان برساند و خدمتی بکند. او سیاستمدار بود. امام جمعه و معاون رییس جمهور و یار نزدیک امام خمینی.
در بخشی از پیام امام آمده است: ما در عین حال که از شهادت و فقدان این بزرگان خدمتگزار به اسلام و محرومین در سوگیم، از نزدیک شدن به هدف اعلا که قطرات خون این شهیدان آن را نوید مى دهند، دلگرم و خرسندیم.
امام در پاسخ به شهید مدنی و شهید صدوقی و دیگرانی که همراهشان بودند، گفتند: اگر این جمعیت حاضر در حسینیه به جای درود بر خمینی عکسش را هم بگویند برای من هیچ تفاوتی نمی کند.
در بخشی از پیام امام آمده است: این جانب دوستى عزیز که بیش از سى سال با او آشنا و روحیات عظیمش را از نزدیک درک کردم از دست دادم و اسلام خدمتگزارى متعهد را و ایران فقیهى فداکار و استان یزد سرپرستى دانشمند را از دست داد.
امام می فرمود خیلی علاقه‌دارم تا آقای مطهری باشد و در دوره جمهوری اسلامی، جامعه ایران و برادران مسلمان بتوانند حداکثر استفاده را از او بنمایند
حضور روحانیون مخالف در ایرانشهر و ایجاد ارتباط میان آنان و آیت الله صدوقی در یزد شرایطی را پدید آورده بود که برخی از معتمدین ایرانشهری توانسته بودند به رساله امام خمینی (س) دسترسی پیدا کنند.
: احساس می کنیم امروز به نذر در راه توسعه و اشتغال در استان نیاز داریم و باید نذوراتی در راه ایجاد کسب و کار و شغلهای نوین و متناسب با نیاز دنیای امروز در شهر و دیارمان داشته باشیم.